Остання редакція: 2015-06-25
Тези доповіді
У багатьох живих організмів, включаючи комах, птахів, ссавців, бактерій та інших були знайдені внутрішньоклітинні біогенні магнітні наночастинки (БМН) у вигляді кристалів магнетиту, маггеміту і грейгіту. Мікроорганізми, які містять у своїх клітинах магнітосоми, що представлені ланцюжками кристалів магнетиту або грейгіту оточених ліпопротеїновою мембраною, широко поширені в природі, вони беруть участь у колообігу заліза та у накопиченні магнетиту в природніх осадах. Завдяки унікальності властивостей БМН вивчення магнітотаксисних (МТБ) бактерій є актуальним з біотехнологічної точки зору [1].
Метою даної роботи є встановлення потенційних продуцентів БМН бактерій типу Cyanobacteria та їх класифікація за наявністю гомологів Mam -білків Magnetospirillium gryphiswaldense MSR-1 та наявністю феритину і феритин-подібних білків в їх протеомах.
Для цього в роботі був проведений біоінформаційний аналіз – вирівнювання білків МО МТБ з білками ціанобатерій, також у роботі було досліджено представників типу Cyanobacteria на наявність в їх геномах феритину [2].
В результаті дослідження було виявлено, що представників ціанобактерій можна умовно поділити на 4 групи. До першої групи можна умовно віднести 3 представники, що містять білок феритин та/або феритин-подібні білки, а також містять гени-гомологи mam-білків МТБ, без яких неможлива біомінералізація, тобто продукують БМН. У другу групу увійшли 3 мікроорганізми, у яких відсутній феритин та/або феритин-подібні білки, штами даної групи містять лише гомологи mam білків сімейства M. gryphiswaldense. До третьої групи було віднесено 92 мікроорганізмів типу Cyanobacteria, які мають власний феритин та/або феритин-подібні білки, але ці штами не мають білків-гомологів mam-білків МО МТБ. Четверта група включає 11 штамів, які не мають гомологів mam-білків МО МТБ та не містять власного феритину та/або феритин-подібних білків.
Було показано, що більшість представників типу Cyanobacteria мають лише феритин та/або феритин-подібні білки, що свідчить про зворотній механізм накопичення заліза.
Посилання
-
Горобець С. В., Горобець О. Ю., Дем’яненко І. В., Сливець О. В. Біоінформаційний аналіз зворотного і незворотного накопичення заліза в Proteobacteria та Actinobacteria.
-
National Center for Biotechnology Information http://www.ncbi.nlm.nih.gov//Blast.cgi