Остання редакція: 2015-06-25
Тези доповіді
Chrysiogenes arsenatis – вид бактерій, єдиний у своєму типі (відділі) Chrysiogenetes. Це – аннаеробний хемолітоавтотрофний організм, який здатний використовувати миш’як в якості кінцевого акцептора електронів при «арсенатному диханні». У випадку цього організму, він споживає миш'як. Як донора електрона використовує ацетат, піруват, D- и L-лактат, фумарат, сукцінат і малат. Являє собою паличковидну зкривлену бактерію, рухому за допомогою одного полярного джгутика.
Тому цікавим було б дослідити здатність представників типу Chrysiogenetes до біомінералізації (незворотній механізм накопичення заліза). Для цього методами порівняльної геноміки було проведено пошук гомологів Мам-білків Magnetospirillium gryphiswaldense MSR-1 в протеомах представників родини Chrysiogenes. Вирівнювання послідовностей проводили за допомогою програмного ресурсу NCBI - «BLAST». При вирівнюванні враховувалися такі параметри: Е-число, відсоток ідентичних та подібних за фізико-хімічними властивостями амінокислот. Для дослідження шляху зворотнього накопичення заліза проводили пошук феритину та/або ферити-подібних білків в протеомах.
Таблиця 1. Результати вирівнювань
mamA
mamB
mamE
mamM
mamN
mamO
ferritin
тип
Chrysiogenes arsenatis
2e-05
(24/42)
1e-18
(32/55)
2e-37 (120/192)
2e-21
(131/160)
-
4e-13
(84/164)
BFR S1
BFR S2
Desulfurispirillum indicum
4e-09
(26/46)
6e-06
(30/56)
4e-35 (142/281)
6e-20
(134/281)
-
9e-14
(91/178)
BFR S1
BFR S2
Виходячи з отриманих даних можна зробити висновок, представники типу Chrysiogenes здатні до незворотнього накопичення заліза, тобто біомінералізації.